Bericht über eine Reise nach Franckreich und der Schweiz, besonders über Handschriften der lateinischen Grammatiker, in: Bericht über die zur Bekanntmachung geeigneten Verhandlungen der Königlichen Preußischen Akademie der Wissenschaften zu Berlin. 1852, S.158-166
C. Plini Caecili Secundi epistularum libri novem. Epistularum ad Traianum liber. Panegyricus. Recognovit Henricus Keil, Leipzig 1853 (mehrfache Aufl., zuletzt Leipzig 1896)
Apollonii Argonautica. Emendavit apparatum criticum et prolegomeno adiecit R. Merkel. Scholia vetera e codice Laurentiano Leipzig 1854 Internet Archive
Grammatici Latini. Acht Bände, Leipzig 1855–80 (ND Hildesheim 1961; 1981)
M. Porci Catonis De agri cultura liber. M. Terenti Varronis Rerum rusticarum libri tres. Ex recensione Henrici Keilii, 2 Bde., Leipzig 1884–1891 (als 3. Bd.: Richard Krumbiegel: Indices verborum, Leipzig 1897–1902)
De Vaticanis grammaticorum latinorum codicibus.. In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 5 (1847), S. 314–320 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Über den Codex des Charisius. In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 5 (1847), S. 467–473 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Ioannis Tzetzae scholiorum in Aristophanem prolegomena (Teil I). In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 6 (1848), S. 108–134 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Chrestomathie des Proklus. In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 6 (1848), S. 141–142 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Das Fragmentum Casinense des Varro de lingua latina. In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 6 (1848), S. 142–145 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Ioannis Tzetzae scholiorum in Aristophanem prolegomena (Teil II). In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 6 (1848), S. 243–257 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Die Veroneser Scholien zu Virgil. In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 6 (1848), S. 369–380 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Die Scholien des Tzetzes zum Aristophanes. In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 6 (1848), S. 616–618 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Supplementum Festi a C. O. Muellero editi. In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 6 (1848), S. 618–626 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Aus den Handschriften der lateinischen Grammatiker, in: Hermes 1 (1866), S. 330–335 DigiZeitschriften