Die Sacra Parallela des Johannes Damascenus, 1897 Internet Archive
Enthusiasmus und Bußgewalt beim griechischen Mönchtum, und Studium zu Symeon der Neuen Theologen, 1898 IA = Google-USA* = Princeton-USA*
Fragmente vornicänischer Kirchenväter aus den Sacra Parallela, 1899 IA = Google-USA* = Princeton
Amphilochius von Ikonium in seinem Verhältnis zu den großen Kappadoziern, 1904 IA = Google-USA* = New York-USA*
Die geist. Übungen des Ignatius von Loyola. Eine psychologische Studie, 1905.
Die Rechtfertigungslehre im Licht der Geschichte des Protestantismus, 1906.
Was hat die Rechtfertigungslehre dem modernen Menschen zu sagen?, 1907.
Der Modernismus, 1908.
Johannes Calvin, Rede zur Feier der 400. Wiederkehr des Geburtstages Calvins, 1909.
Die handschriftliche Überlieferung des Epiphanius, 1910.
Thomas Chalmers und die Anfänge der kirchlich-sozialen Bewegung, 1913.
Was verstand Luther unter Religion?, Tübingen 1917 Princeton-USA*
Die Bedeutung der grossen Kriege für das religiöse und kirchliche Leben innerhalb des deutschen Protestantismus : Vorträge gehalten beim Kriegslehrgang des Zentralausschusses für innere Mission in Warschau und Wilna am 8. u. 12. Dezember 1916, Tübingen 1917 California-USA*, Wisconsin-USA*
Der Kirchenbegriff des Paulus in seinem Verhältnis zu dem der Urgemeinde, 1921.
Geschichtliche Aufsätze zur Kirchengeschichte I.: Luther, 1921.
Die Frage des Zinsnehmens und des Wuchers in der reformierten Kirche, in: Festgabe für D. Dr. Karl Müller zum siebzigsten Geburtstag, Tübingen 1922 Princeton-USA*
Das Apokryphen Ezechiel, in: Aus Schrift und Geschichte. Theologische Abhandlungen A. Schlatter... dargebracht, Stuttgart 1922, S. 85–98 = ders., Aufsätze Bd. 2, S. 33–43.
Augustins innere Entwicklung, 1923.
Urchristentum und Religionsgeschichte, 1924.
Die Entstehung der vier Fastenzeiten in der griechischen Kirche, 1924.
Christliche Reden, 1926.
Geschichtliche Aufsätze zur Kirchengeschichte II.: Der Osten, 1927/28. Commons, daraus:
