Schedae criticae de Pleiade tragicorum graecorum. Halle 1812
Choerili Samii opera quae supersunt collegit et illustravit, de Choerili Samii aetate, vita et poesi aliisque Choerilis. Leipzig 1817 Google, Google, Google, Google
mit Barthold Georg Niebuhr: Über das Alter des Lieds Lydia bella puella. Mit zwey ungedruckten lateinischen Liedern aus der spätesten römischen Zeit. Nebst einem Nachtrag von Herrn Professor Näke. In: Rheinisches Museum für Philologie, Geschichte und griechische Philosophie. Band 3 (1829), S. 1–10 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Valerii Catonis Poemata, ed. C. Putschius. In: Rheinisches Museum für Philologie, Geschichte und griechische Philosophie. Band 3 (1829), S. 148–152 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
De allitteratione sermonis latini. In: Rheinisches Museum für Philologie, Geschichte und griechische Philosophie. Band 3 (1829), S. 324–418 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Dissertatio de Callimachi Hecale. Bonn 1829 (Festschrift) Google
Dikäarchus, περὶ μουσικῶν ἀγώνων und βίος Ἑλλάδος. In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 1 (1832), S. 40–59 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Nachtrag zu S. 56 u. folgg. In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 1 (1832), S. 158–166 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
Karl August Varnhagen von Ense (Hrsg.): Wallfahrt nach Sessenheim. Die ersten Nachforschungen über das Liebesidyll von Goethe und Friederike. Berlin 1840
Friedrich Gottlieb Welcker (Hrsg.): Augusti Ferdinandi Naekii opuscula philologica. Zwei Bände, Bonn 1842–1845
Ludwig Schopen (Hrsg.): Carmina Valerii Catonis cum A. F. Naekii annotationibus. Bonn 1847 Google
(Friedrich Ritschl:) August Ferdinand Näke über die thebanische Tetralogie des Aeschylus. In: Rheinisches Museum für Philologie. Band 27 (1872), S. 193–214 DFG/Rheinisches Museum (PDF)
