mit Franz Joseph Würtenberger: Der Weisse Jura im Klettgau und angrenzenden Randengebirg. In: Verhandlungen des naturwissenschaftlichen Vereins in Carlsruhe, Band 2, Müller, Karlsruhe 1866, S. 11–68
Die Schichtenfolge des Schwarzen und Braunen Jura im Klettgau. In: Neues Jahrbuch für Mineralogie, Geologie und Palaeontologie, Jg. 1867, S. 39–59 Google
Einige Beobachtungen im Weissen Jura des oberen Donauthales. In: Neues Jahrbuch für Mineralogie, Geologie und Palaeontologie, Jg. 1868, S. 540–547 Google
Ueber die Entstehung der Gesteinsarten und ihre gegenseitigen Verwandtschaften. In: Die Natur, Band 19, 1870, Nr. 14, S. 110–112; Nr. 15, S. 118–120; Nr. 17, S. 135–136; Nr. 18, S. 141–144; Nr. 20, S. 158–160 Google
mit Franz Joseph Würtenberger: Petrefacten-Handel. Verkauf von Weissjura-Ammoniten. In: Neues Jahrbuch für Mineralogie, Geologie und Palaeontologie, Jg. 1871, S. 223 Google
Über die Entstehung des Schaffhauser Rheinfalles. In: Neues Jahrbuch für Mineralogie, Geologie und Palaeontologie, Jg. 1871, S. 582–588 Google
Die Vogesenhalbinsel im Jurameer und der Elsässer Golf. In: Globus, Band 20, 1871, Nr. 1, S. 8–10 Google
Ueber geologische Forschungen im Orient. In: Das Ausland, Band 44, 1871, Nr. 22, S. 524–528 Google
Untersuchungen über die Bildung des Rheinfalles. In: Das Ausland, Band 44, 1871, Nr. 43, S. 1015–1017; Nr. 44, S. 1047–1050; Nr. 46, S. 1098–1101; Nr. 49, S. 1174–1176 Google; Band 45, 1872, Nr. 7, S. 158–160; Nr. 9, S. 212–215 Google
Ueber den Ursprung der Föhnstürme. In: Deutsche Warte, Band 1, 1871, S. 170–173 Google
Ueber neuere Forschungen im Gebiete der Jurageognosie. In: Ergänzungsblätter zur Kenntniß der Gegenwart, Jg. 1871, Verlag des Bibliographischen Instituts, Hildburghausen 1871, S. 743–749 Google
Neuer Beitrag zum geologischen Beweise der Darwin’schen Theorie. In: Das Ausland, Band 46, 1873, Nr. 1, S. 6–10; Nr. 2, S. 25–29 Google
Ein Gegner der Darwin’schen Theorie. In: Deutsche Warte, Band 4, 1873, S. 673–679 Google
Ueber mikroskopische Gesteinstudien. In: Deutsche Warte, Band 5, 1873, S. 33–38 Google
Zur Darwin-Literatur. In: Deutsche Warte, Band 5, 1873, S. 513–520 Google
Häckel’s Monographie der Kalkschwämme. In: Gaea, Band 9, 1873, S. 447–450 Google
Überblick über die klimatischen Verhältnisse. In: Das Großherzogtum Baden in geographischer, naturwissenschaftlicher, geschichtlicher, wirtschaftlicher und staatlicher Hinsicht dargestellt. Nebst vollständigem Ortsverzeichnis. Bielefeld, Karlsruhe 1885, S. 73–83 Internet Archive = Google-USA*, Internet Archive = Google-USA*
Matthias Svojtka, Johannes Seidl u. Michel Coster Heller: Frühe Evolutionsgedanken in der Paläontologie. Materialien zur Korrespondenz zwischen Charles Robert Darwin und Melchior Neumayr. In: Jahrbuch der Geologischen Bundesanstalt, Band 149, 2009, S. 357–374 Oberösterreichisches Landesmuseum[mit Publikationsverzeichnis Würtenbergers]