Hochdeutsches Wörterbuch nach den Endsylben geordnet. Ein bequemes Hülfsmittel beym Sprachunterrichte, bey der Rechtschreibung und dem Reime. Weißenfels und Leipzig 1800 Google
Herodoti Halicarnassei historiarum libri IX. ex optimis exemplaribus emendavit ac notas criticas adiecit. Vier Bände, Leipzig 1800–1803
Longi Pastoralia Graece et Latine cum proloquio P. M. Paciaudii de libris eroticis antiquorum. Graeca recensuit notasque criticas adiecit G. H. Schäfer. Leipzig 1803 Google
C. Plinii Caecilii Secundi epistolarum libri decem et panegyricus ex recensione et cum adnotationibus perpetuis Io. Matthiae Gesneri quibus Io. Michaelis Heusingeri Io. Christ. Theoph. Ernestii suasque notas addidit Godofr. Henr. Schaefer.. Leipzig 1805 Google, Google
Lamberti Bos Ellipses Graecae: cum priorum editorum suisque observationibus. Leipzig und London 1808 Google. Nachdruck Glasgow 1813 Google
Theocritus Bion et Moschus ad optimorum librorum fidem emendati cum brevi notatione emendationum. Leipzig 1809 Google. Nachdruck Leipzig 1829 Google
Apollonii Rhodii Argonautica: ex recensione et cum notis Richard Fr. Phil. Brunckii. Acc. scholia graeca ex codice biblioth. imperial. Paris. nunc primum evulgata. Zwei Bände, Leipzig 1810–1813
Demosthenes quae supersunt ex editione Ioa. Iac. Reiskii accedunt versio latina, apparatus criticus & exegeticus aliorum et suis annotationibus auctus cum indicibus in Demosthenem edente Godofredo Henrico Schaefero. Drei Bände, London 1822–1826
Sophoclis tragoediae septem ad optimorum exemplarium fidem ac praecipue codicis vetustissimi Florentini a Petro Elmsleio collati emendatae cum annotatione tantum non integra Brunckii et Schaeferii et aliorum selecta. Accedunt deperditarum tragoediarum fragmenta. Acht Bände, Leipzig 1827
