De telis quibusdam astaci fluviatilis. Dissertatio inauguralis histologica quam consensu et auctoritate gratiosi medicorum ordinis in alma litterarum universitate Friderica guilelma ut summi in medicina chirurgia honores rite sibi concedantur die VII. M. Martii A. MDCCCLVII. Publice defendet. Typis Gustavi Schade, Berlin 1857 California
De rhizopodum finibus et ordinibus. Dissertatio quam rectore academiae magnificentissimo serenissimo principe ac domino domino Carolo Alexandro. Georg Reimer, Berlin 1861 MDZ München
Die Radiolarien. (Rhizopoda Radiaria.) Eine Monographie. Georg Reimer, Berlin
Beiträge zur Naturgeschichte der Hydromedusen. 1. Heft: Die Familie der Rüsselquallen (Geryonida). Eine Monographie. Mit 6 Kupfertafeln und in den Text gedruckten Holzschnitten. Wilhelm Engelmann, Leipzig 1865 Internet Archive, Internet Archive = Google, MDZ München = Google[erste Seiten fehlen, folgende sind zum Teil unlesbar]
1. Band: Allgemeine Anatomie der Organismen. Kritische Grundzüge der mechanischen Wissenschaft von den entwickelten Formen der Organismen, begründet durch die Descendenz-Theorie. Mit zwei promorphologischen Tafeln. Internet Archive = Google, MDZ München = Google, Gallica, Biblioteca de l’Ateneu
Prinzipien der generellen Morphologie der Organismen. Wörtlicher Abdruck eines Teiles der 1866 erschienenen generellen Morphologie (Allgemeine Grundzüge der organischen Formen-Wissenschaft, mechanisch begründet durch die von Charles Darwin reformierte Deszendenz-Theorie). Mit dem Porträt des Verfassers. Georg Reimer, Berlin 1906 Internet Archive, Princeton-USA*
Natürliche Schöpfungsgeschichte. Gemeinverständliche wissenschaftliche Vorträge über die Entwickelungslehre im Allgemeinen und diejenige von Darwin, Goethe und Lamarck im Besonderen.
1. Auflage. Über die Anwendung derselben auf den Ursprung des Menschen und andere damit zusammenhängende Grundfragen der Naturwissenschaft. Mit Tafeln, Holzschnitten, systematischen und genealogischen Tabellen. Georg Reimer, Berlin 1868 Internet Archive, Internet Archive, E-Text MPIZ-Köln
2., verbesserte und vermehrte Auflage. Über die Anwendung derselben auf den Ursprung des Menschen und andere damit zusammenhängende Grundfragen der Naturwissenschaft. Mit 15 Tafeln, 19 Holzschnitten, 18 Stammbäumen und 19 systematischen Tabellen. Georg Reimer, Berlin 1870 Google = Madrid
3. verbesserte Auflage. Mit 15 Tafeln, 19 Holzschnitten, 18 Stammbäumen und 19 systematischen Tabellen. Georg Reimer, Berlin 1872 New York
4. verbesserte Auflage. Mit 16 Tafeln, 19 Holzschnitten, 18 Stammbäumen und 19 systematischen Tabellen. Georg Reimer, Berlin 1873 Internet Archive, Cornell
8. umgearbeitete und vermehrte Auflage. Mit dem Porträt des Verfassers und mit 20 Tafeln, sowie zahlreichen Holzschnitten, Stammbäumen und systematischen Tabellen. Georg Reimer, Berlin 1889 Internet Archive, Google-USA* = California-USA*, Princeton-USA*
9. umgearbeitete und vermehrte Auflage. Mit dem Porträt des Verfassers und mit 30 Tafeln, sowie zahlreichen Holzschnitten, Stammbäumen und systematischen Tabellen. Georg Reimer, Berlin 1898 Google-USA* = Michigan-USA*, Internet Archive = Google-USA*
10. verbesserte Auflage. Mit dem Porträt des Verfassers und mit 30 Tafeln, sowie zahlreichen Holzschnitten, Stammbäumen und systematischen Tabellen. Georg Reimer, Berlin 1902 Internet Archive = Google-USA*
unbekannte Ausgabe Wisconsin[Titelseite fehlt, vermutlich 5. oder 6. Auflage ]
Ueber die Entstehung und den Stammbaum des Menschengeschlechts. Zwei Vorträge.
1. Auflage. C. G. Lüderitz’sche Buchhandlung. A. Charisius, Berlin 1868 MDZ München = Google
3. verbesserte Auflage. C. G. Lüderitz’sche Verlagsbuchhandlung. Carl Habel, Berlin 1873 Internet Archive = Google
Ueber Arbeitstheilung in Natur- und Menschenleben. Vortrag, gehalten im Saale des Berliner Handwerker-Vereins am 17. Dezember 1868. Mit einem Titelkupfer und 18 in den Text eingedruckten Holzschnitten. C. G. Lüderitz’sche Verlagsbuchhandlung. A. Charisius, Berlin 1869 Google, Google = Princeton, Google = Columbia, UB Tartu, MPIZ-Köln
Zur Entwickelungsgeschichte der Siphonophoren. Beobachtungen über die Entwickelungsgeschichte der Genera Physophora, Crystallodes, Athorybia, und Reflexionen über die Entwickelungsgeschichte der Siphonophoren im Allgemeinen. Eine von der Utrechter Gesellschaft für Kunst und Wissenschaft gekrönte Preisschrift. Mit vierzehn Tafeln. C. van der Post Jr., Utrecht 1869 Internet Archive = Google = Wisconsin, Google = Columbia, Google
Das Leben in den grössten Meerestiefen. Vortrag, gehalten am 2. März 1870 im akademischen Rosensaale zu Jena. Mit 1 Titelbild in Kupferstich und 3 Holzschnitten. C. G. Lüderitz’sche Verlagsbuchhandlung. A. Charisius, Berlin 1870 Internet Archive = Google, SLUB Dresden, MPIZ-Köln
Biologische Studien.
1. Heft: Studien über Moneren und andere Protisten. Nebst einer Rede über Entwickelungsgang und Aufgabe der Zoologie. Mit 6 Kupfertafeln. Wilhelm Engelmann, Leipzig 1870 Internet Archive = Google
2. Heft: Studien zur Gastraea-Theorie. Mit 14 Tafeln. Hermann Dufft, Jena 1877 Internet Archive
Die Kalkschwämme. Eine Monographie in zwei Bänden Text und einem Atlas mit 60 Tafeln Abbildungen. Georg Reimer, Berlin 1872
Anthropogenie oder Entwickelungsgeschichte des Menschen. Gemeinverständliche wissenschaftliche Vorträge über die Grundzüge der menschlichen Keimes- und Stammesgeschichte. Wilhelm Engelmann, Leipzig
4., umgearbeitete und vermehrte Auflage. 2. Theil. Stammesgeschichte oder Phylogenie. Mit 20 Tafeln, 440 Holzschnitten und 52 genetischen Tabellen. 1891 Internet Archive, Internet Archive = Google-USA*
5. umgearbeitete und vermehrte Auflage. 1. Teil. Keimesgeschichte oder Ontogenie. Mit 30 Tafeln, 512 Textfiguren und 60 genetischen Tabellen. 1903 Internet Archive = Google-USA* = Princeton-USA*
5. umgearbeitete und vermehrte Auflage. 2. Teil. Stammesgeschichte oder Phylogenie. Mit 30 Tafeln, 512 Textfiguren und 60 genetischen Tabellen. 1903 Princeton-USA*
Arabische Korallen. Ein Ausflug nach den Korallenbänken des Rothen Meeres und ein Blick in das Leben der Korallenthiere. Populäre Vorlesung mit wissenschaftlichen Erläuterungen. Mit fünf Tafeln in Farbendruck und zwanzig Holzschnitten. Georg Reimer, Berlin 1876 Internet Archive = Biodiversity Heritage Library
Die heutige Entwickelungslehre im Verhältnisse zur Gesammtwissenschaft. Vortrag in der ersten öffentlichen Sitzung der fünfzigsten Versammlung Deutscher Naturforscher und Aerzte zu München am 18. September 1877. E. Schweizerbart’sche Verlagshandlung (E. Koch), Stuttgart
Das Protistenreich. Eine populäre Uebersicht über das Formengebiet der niedersten Lebewesen. Mit einem wissenschaftlichen Anhange: System der Protisten. Mit zahlreichen Holzschnitten. Ernst Günther’s Verlag, Leipzig 1878 Internet Archive = Internet Archive = Google-USA* = UB Michigan, Gallica, MPIZ-Köln
Freie Wissenschaft und freie Lehre. Eine Entgegnung auf Rudolf Virchow’s Münchener Rede über „Die Freiheit der Wissenschaft im modernen Staat“.
Gemeinverständliche Vorträge und Abhandlungen aus dem Gebiete der Entwickelungslehre. 2., vermehrte Auflage der Gesammelten populären Vorträge Heft 1 und 2. 1. Band mit 51 Abbildungen im Text und einer Tafel in Farbendruck. Emil Strauß, Bonn 1902 Internet Archive = Google-USA*, Princeton-USA*
Gemeinverständliche Vorträge und Abhandlungen aus dem Gebiete der Entwickelungslehre. 2., vermehrte Auflage der Gesammelten populären Vorträge Heft 1 und 2. 2. Band mit 50 Abbildungen im Text und einer Tafel in Farbendruck. Emil Strauß, Bonn 1902 Internet Archive = Google-USA*
Monographie der Medusen. 1. Band der Denkschriften der medicinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena.
Das System der Medusen. 1. Theil einer Monographie der Medusen. Mit einem Atlas von vierzig Tafeln. Gustav Fischer, Jena 1879 Internet Archive
System der Acraspeden. 2. Hälfte des Systems der Medusen. O. V., o. O. o. J. Internet Archive
Die Tiefsee-Medusen der Challenger-Reise und der Organismus der Medusen. 2. Theil einer Monographie der Medusen. Mit einem Atlas von zweiunddreissig Tafeln und mit acht Holzschnitten. Gustav Fischer, Jena 1881 Internet Archive, Internet Archive = Google-USA* = Chicago-USA*
Die Tiefsee-Medusen der Challenger-Reise und der Organismus der Medusen. 2. Theil einer Monographie der Medusen. Atlas. Gustav Fischer, Jena 1881 Internet Archive
Plankton-Studien. Vergleichende Untersuchungen über die Bedeutung und Zusammensetzung der Pelagischen Fauna und Flora. Gustav Fischer, Jena 1890 Internet Archive, Internet Archive = Google-USA*
Der Monismus als Band zwischen Religion und Wissenschaft. Glaubensbekenntniss eines Naturforschers, vorgetragen am 9. October 1892 in Altenburg beim 75jährigen Jubiläum der Naturforschenden Gesellschaft der Osterlandes.
48. bis 67. Tausend. Volks-Ausgabe. Mit einem Nachworte: Das Glaubensbekenntniß der Reinen Vernunft. Emil Strauß, Bonn 1903 Internet Archive = Google-USA* = Wisconsin-USA*
78. bis 91. Tausend. Volks-Ausgabe. Mit einem Nachworte: Das Glaubensbekenntniß der Reinen Vernunft. Emil Strauß, Bonn 1903 Internet Archive = Google-USA* = California-USA*
108.–120. Tausend. Volks-Ausgabe. Mit einem Nachworte: Das Glaubensbekenntniß der Reinen Vernunft. Emil Strauß Verlag, Stuttgart [1903?] California-USA*
131.–140. Tausend. Volks-Ausgabe. Mit einem Nachworte: Das Glaubensbekenntniß der Reinen Vernunft. Alfred Kröner Verlag, Stuttgart [1903?] Google-USA*
141.–150. Tausend. Volks-Ausgabe. Mit einem Nachworte: Das Glaubensbekenntniß der Reinen Vernunft. Alfred Kröner Verlag, Stuttgart [1903?] Internet Archive
171.–180. Tausend. Volks-Ausgabe. Mit einem Nachworte: Das Glaubensbekenntniß der Reinen Vernunft. Alfred Kröner Verlag, Stuttgart o. J. MPIZ-Köln
251.–260. Tausend. Kröners Volksausgabe. Mit Nachträgen zur Begründung der monistischen Weltanschauung. Alfred Kröner Verlag, Leipzig [1908?] New York-USA*
291.–300. Tausend. Taschenausgabe. Alfred Kröner Verlag, Leipzig [1908?] Google-USA*
Neu bearbeitete Taschenausgabe. Alfred Kröner Verlag, Leipzig 1909 Internet Archive
371.–380. Tausend. Alfred Kröner Verlag, Stuttgart 1921 Internet Archive
381.–390. Tausend. Kröners Taschenausgabe Band 1. Alfred Kröner Verlag, Leipzig 1922 Internet Archive
Ueber unsere gegenwärtige Kenntniss vom Ursprung des Menschen. Vortrag, gehalten auf dem Vierten Internationalen Zoologen-Congress in Cambridge, am 26. August 1898.
1. Auflage. Mit erläuternden Anmerkungen und Tabellen. Emil Strauss, Bon 1898 Internet Archive = Google-USA*
Die Lebenswunder. Gemeinverständliche Studien über Biologische Philosophie. Ergänzungsband zu dem Buche über die Welträthsel. Alfred Kröner Verlag, Stuttgart
Der Kampf um den Entwickelungs-Gedanken. Drei Vorträge, gehalten am 14., 16. und 19. April 1905 im Saale der Sing-Akademie zu Berlin. Mit drei Tafeln und einem Porträt. Georg Reimer, Berlin
6. bis 10. Tausend. Georg Reimer, Berlin 1905 Google-USA*
Monismus und Naturgesetz. 1. Heft der Flugschriften des Deutschen Monistenbundes. 2. Auflage. Dr. W. Breitenbach, Brackwede i. W. 1907 Princeton-USA*
Das Menschen-Problem und die Herrentiere von Linné. Votrag, gehalten am 17. Juni 1907 im Volkshause zu Jena. 7. und 8. Tausend. Neuer Frankfurt Verlag G. m. b. H., Frankfurt a. M. 1907 o. 1908 MPIZ-Köln
Alte und neue Naturgeschichte. Festrede zur Übergabe des phyletischen Museums an die Universität Jena bei Gelegenheit ihres 350jährigen Jubiläums am 30. Juli 1908. Gustav Fischer, Jena 1908 Princeton-USA*
Zellseelen und Seelenzellen. Votrag, gehalten am 22. März 1878 in der „Concordia“ zu Wien. Alfred Kröner Verlag, Leipzig 1909 Princeton-USA*, MIPZ-Köln
Das Weltbild von Darwin und Lamarck. Festrede zur hundertjährigen Geburtstagsfeier von Charles Darwin am 12. Februar 1909 gehalten im Volkshause zu Jena. 2. Auflage. Alfred Kröner Verlag, Leipzig 1909 Internet Archive
Die Natur als Künstlerin. Nebst: Dr. W. Breitenbach, Formenschatz der Schöpfung. Mit 76 Bildertafeln, darunter zwei Farbigen. Vita Deutsches Verlagshaus, Berlin-Ch. 1913 MPIZ-Köln
I. Psyche (1910). II. Ein Jubiläum der Menschenkunde (1913). Zwei Aufsätze (XI. und XII.) aus der Sammlung Monistische Bausteine. Mit einer Einleitung herasugegeben zum 16. Februar 1914 von Wilhelm Breitenbach. Dr. W. Breitenbach, Brackwede i. W. 1914 MPIZ-Köln
In: Victor Franz (Hg.): Ernst Haeckel. Sein Leben, Denken und Wirken. Eine Schriftenfolge für seine zahlreichen Freunde und Anhänger. Gronau, Jena und Leipzig 1943, S. 73–82 Commons
Fünfzig Jahre Stammesgeschichte. Historisch-kritische Studien über die Resultate der Phylogenie. Gustav Fischer, Jena 1916 Princeton-USA*
Kristallseelen. Studien über das anorganische Leben. Mit 1 Tafel in Farbdruck und zahlreichen Abbildungen im Text. Alfred Kröner Verlag, Leipzig 1917 ULB Düsseldorf, California-USA*, Princeton-USA*, MPIZ-Köln
Natur und Mensch. Sechs Abschnitte aus Werken von Ernst Haeckel. Herausgegeben und mit einer Einleitung versehen von Carl W. Neumann. Mit dem Bildnis Ernst Haeckels und zahlreichen Abbildungen im Text. Philipp Reclam jun., Leipzig o. J. Internet Archive
Die Amphorideen und Cystoideen. Beiträge zur Morphologie und Phylogenie der Echinodermen. Mit Tafel I–V und 25 Figuren im Text. O. V., o. O. o. J Internet Archive
3., vermehrte Auflage. Mit dem Portrait des Reisenden und 20 Illustrationen in Lichtdruck (nach Photogrammen und Original-Aquarellen des Verfassers), sowie mit einer Karte der Insel Ceylon. Gebrüder Paetel, Berlin 1893 UB Regensburg
4. Auflage. Mit dem Portrait des Reisenden und 20 Illustrationen in Lichtdruck (nach Photogrammen und Original-Aquarellen des Verfassers), sowie mit einer Karte der Insel Ceylon. Gebrüder Paetel, Berlin 1903 Wisconsin-USA*
2. Auflage. Mit 72 Abbildungen und 4 Karten im Text sowie 8 Tafeln. Alfred Kröner Verlag, Leipzig 1909 California-USA*
Ernst Haeckels Wanderbilder. Nach eigenen Aquarellen und Ölgemälden. 1. und 2. Serie: Die Naturwunder der Tropenwelt. Ceylon und Insulinde. W. Koehler’sche Verlagsbuchhandlung, Gera-Untermbaum [1904?] MPIZ-Köln, Farblithographien auf Commons
Von Teneriffa bis zum Sinai. Reiseskizzen. Mit vier farbigen Tafeln nach Aquarellen Ernst Haeckels und einem Portrait. Alfred Kröner Verlag, Leipzig 1923 UB Regensburg
Margarete Jodl (Hg.): Bartholomäus von Carneri’s Briefwechsel mit Ernst Haeckel und Friedrich Jodl. K. F. Koehler, Leipzig 1922 Internet Archive = Google-USA* = Wisconsin-USA*
Rudolph Koop (Hg.): Haeckel und Allmers. Die Geschichte einer Freundschaft in Briefen der Freunde. Herausgegeben auf Veranlassung der Hermann-Allmers-Gesellschaft in Rechtenfleth. Mit einem Geleitwort von o. Professor Dr. V. Franz. Arthur Geist Verlag, Bremen 1941 MPIZ-Köln
Aus dem pathologisch-anatomischen Curse des Prof. Virchow in Würzburg. In: Wiener Medizinische Wochenschrift, 6. Jahrgang (1856)
I. Ueber die Beziehungen des Typhus zur Tuberculose. 5. Jänner 1856, Nr. 1, Sp. 1–5 ÖNB-ANNO
I. Ueber die Beziehungen des Typhus zur Tuberculose. (Schluss.) 12. Jänner 1856, Nr. 2, Sp. 17–20 ÖNB-ANNO
II. Fibroid des Uterus. 16. Februar 1856, Nr. 7, Sp. 97–101 ÖNB-ANNO
Ueber die Gewebe des Flusskrebses. (Hierzu Tafel XVIII. XIX.) In: Archiv für Anatomie, Physiologie und wissenschaftliche Medicin. Jahrgang 1857. Veit et Comp., Berlin, S. 469–568 Internet Archive
Die Familie der Rüsselquallen. IV.–IX. In: Jenaische Zeitschrift für Medicin und Naturwissenschaft herausgegeben von der medicinisch-naturgesellschaftlichten Gesellschaft zu Jena. 2. Band. Wilhelm Engelmann, Leipzig 1866, S. 93–120; 129–202; 263–322 Google
Monographie der Moneren. In: Jenaische Zeitschrift für Medicin und Naturwissenschaft herausgegeben von der medicinisch-naturgesellschaftlichten Gesellschaft zu Jena. 4. Band. Wilhelm Engelmann, Leipzig 1868, S. 64–137 Google
Ueber den Organimus der Schwämme und ihre Verwandtschaft mit den Corallen. In: Jenaische Zeitschrift für Medicin und Naturwissenschaft herausgegeben von der medicinisch-naturgesellschaftlichten Gesellschaft zu Jena. 5. Band. Wilhelm Engelmann, Leipzig 1868, S. 207–235 Google
Prodromus eines Systems der Kalkschwämme. Ebenda, S. 236–254
Ueber Entwickelungsgang und Aufgabe der Zoologie. Ebenda, S. 353–370
Ursprung und Entwickelung der thierischen Gewebe. Ein histogenetischer Beitrag zur Gastraea-Theorie. (Separat-Abdruck aus der Jen. Zeitschrift für Naturwissenschaft Bd. XVIII N. F. XI. Bd.) Gustav Fischer, Jena 1884 Columbia-USA*, California-USA*
System der Siphonophoren. Auf phylogenetischer Grundlage entworfen. In: Jenaische Zeitschrift für Naturwissenschaft herausgegeben von der medicinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena. 22. Band. Neue Folge, 15. Band. Mit 23 Tafeln und 8 Abbildungen im Texte. Mauke’s Verlag (Hermann Dufft), Jena 1888 MPIZ-Köln
Separatabdruck aus der Jenaischen Zeitschrift für Naturwissenschaft. XXII. Band. Gustav Fischer, Jena 1888 California
Die cambrische Stammgruppe der Echinodermen. Vorläufige Mittheilung. Vorgetragen in der Sitzung der Medicinisch-Naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena am 13. December 1895. Abdruck aus der Jenaischen Zeitschrift für Naturwissenschaft. XXX. Bd. N. F. XXIII. Gustav Fischer, Jena 1895 Columbia-USA*
Fritz Müller-Desterro. Ein Nachruf. In: Jenaische Zeitschrift für Naturwissenschaft herausgegeben von der medizinisch-naturgesellschaftlichten Gesellschaft zu Jena. Einunddreissigster Band. Neue Folge, Vierundzwanzigster Band. Gustav Fischer, Jena 1898, S. 156–173 Google-USA*
Aufsteigende und absteigende Zoologie. Ebenda, S. 469–474
Vorwort. In: Die moderne Weltanschauung und der Mensch. Sechs öffentliche Vorträge von Benjamin Vetter. Gustav Fischer, Jena
4. Auflage. Mit einem Vorwort des Herrn Professor Dr. Ernst Haeckel in Jena. Mit einem Bildnis der Verfassers. 1903 Princeton-USA*
5. Auflage. Mit einem Vorwort von Professor Dr. Ernst Haeckel in Jena und einem Bildnis des Verfassers. 1906 New York-USA*
Illustrationen in: Wilhelm Bölsche: Von Sonnen und Sonnenstäubchen. Kosmische Wanderungen. Mit vier farbigen und vier schwarzen Tafeln nach Original-Aquarellen von Professor Ernst Haeckel. 2. unveränderte Auflage. Georg Bondi, Berlin 1903 Internet Archive = California-USA*
Über die Biologie in Jena während des 19. Jahrhunderts. Votrag, gehalten in der Sitzung der medizinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft am 17. Juni 1904. Abdruck aus der Jenaischen Zeitschrift für Naturwissenschaft Band XXXIX, N. F. XXXII. Gustav Fischer, Jena 1905 Princeton-USA*
Vorwort in: Alexander Sokolowsky: Beobachtungen über die Psyche der Menschenaffen. Mit einem Vorwort von Ernst Haeckel. Neuer Frankfurt Verlag G. m. b. H., Frankfurt am Main 1908 California-USA*, Michigan-USA*
Johannes Huber: Zur Kritik moderner Schöpfungslehren mit besonderer Rücksicht auf Häckel’s Natürliche Schöpfungsgeschichte. Theodor Ackermann, München 1875 Internet Archive = Google = Michigan, Columbia
Friedrich Michelis: Haeckelogonie. Ein akademischer Protest gegen Häckel’s „Anthropogenie“. 2. mit einer kritischen Abrechnung als Vorwort versehene Auflage. P. Neusser, Bonn 1876 California
Carl Semper: Der Haeckelismus in der Zoologie. Ein Vortrag, gehalten am 28. October 1875 im Verein für Kunst und Wissenschaft zu Hamburg, unter dem Titel „Der neue Glaube und die moderne Zoologie.“ 2. Auflage. W. Mauke’s Söhne, Hamburg 1876 Michigan
Victor Hensen: Die Plankton-Expedition und Haeckel’s Darwinismus. Ueber einige Aufgaben und Ziele der beschreibenden Naturwissenschaften. Mit zwei Steindrucktafeln. Lipsius & Tischer, Kiel und Leipzig 1891 California-USA*, Michigan-USA*
Bericht über die Feier des sechszigsten Geburtstages von Ernst Haeckel am 17. Februar 1894 in Jena. O. V., o. O. o. J. Princeton[erste Seite fehlt]
Heinrich Schmidt: Der Kampf um die „Welträtsel“. Ernst Haeckel, die „Welträtsel“ und die Kritik. 2. unveränderte Auflage. (3. und 4. Tausend.) Emil Strauss, Bonn 1900 Internet Archive = Google-USA* = Wisconsin-USA*
Julius Baumann: Häckels Welträthsel nach ihren starken und ihren schwachen Seiten mit einem Anhang über Häckels theologische Kritiker. 2. durchgesehene, im Anhang vermehrte Auflage. Dieterichsche Verlagsbuchhandlung, Leipzig 1900 Google-USA* = California-USA*
Anton Michelitsch: Haeckelismus und Darwinismus. Eine Antwort auf Haeckels „Welträthsel“. Verlags-Buchhandlung ‚Styria‘, Graz 1900 New York-USA*
Rudolf Steiner: Haeckel und seine Gegner. J. C. C. Bruns’ Verlag, Minden i. Westf. 1900 Internet Archive = Google-USA*
Richard Hönigswald: Ernst Haeckel, der monistische Philosoph. Eine kritische Antwort auf seine „Welträthsel“. Eduard Avenarius, Leipzig 1900 Internet Archive = Google-USA*
Julius B. Staub: Die Welt ohne Räthsel. Die consequente Durchführung der modernen naturwissenschaftlichen Auffassung des Daseins als einen Mechanismus, unter Bezugnahme auf Häckels neuestes Werk „Die Welträthsel“. Mit einem Anhang. Die Grundlage einer von Grund aus neuen Ethik und Die Entschleierung des Geheimnisses, auf dem die für den Flugapparat des Menschen erforderliche Tragfähigkeit der Luft beruht. Arwed Strauch, Leipzig [1900?] Wisconsin-USA*
Erich Adickes: Kant contra Haeckel. Reuther & Reichard, Berlin
2., verbesserte und vermehrte Auflage. Für den Entwicklungsgedanken – – gegen naturwissenschaftlichen Dogmatismus. 1906 Internet Archive = Google-USA* = California-USA*
Richard Wagner: Aether und Wille oder Haeckel und Schopenhauer. Eine neue Loesung der Weltraetsel. Hermann Seemann Nachfolger, Leipzig 1901 California-USA*
Adolf Müller: Scheinchristentum und Haeckels Welträtsel. Ein Vergleich. Friedrich Andreas Perthes, Gotha 1901 California-USA*
Festschrift zum siebzigsten Geburtstage von Ernst Haeckel. Herausgegeben von seinen Schülern und Freunden. Mit 16 Tafeln und 109 Abbildungen im Text. Gustav Fischer, Jena 1904 Internet Archive = Google-USA* = Cornell-USA*
Hans Bélart: Ernst Häckel’s Naturphilosophie. Franz Wunder, Berlin 1905 Chicago-USA*
Paul Apel: Geist und Materie. Allgemeinverständliche Einführung in die philosophischen Probleme. Mit einem Anhang: Haeckel und die Philosophie. 2. vermehrte Auflage. Conrad Skopnik, Berlin 1905 California-USA*
Ludwig Goldschmidt: Kant und Haeckel. Freiheit und Naturnotwendigkeit. Nebst einer Replik an Julius Baumann.
Johannes Reinke: Haeckels Monismus und seine Freunde. Ein freies Wort für freie Wissenschaft. 3. und 4. Tausend. Johann Ambrosius Barth, Leipzig 1907 Wisconsin-USA*
Joseph Engert: Der Naturalistische Monismus Haeckels. Auf seine wissenschaftliche Haltbarkeit geprüft. Von der theologischen Fakultät der Universität Würzburg gekrönte Preisschrift. Mayer & Co., Wien 1907 Wisconsin-USA*
Adolf Hansen: Haeckels „Welträtsel“ und Herders Weltanschauung. Alfred Töpelmann, Giessen 1907 California-USA*
Max Apel: Die Weltanschauung Haeckels. Dargestellt und kritisch beleuchtet. Buchverlag der „Hilfe“ G. m. b. H., Berlin-Schöneberg 1908 Google-USA* = Michigan-USA*
Arnold Braß: Professor E. Haeckel’s Darstellungs- und Kampfesweise sachlich dargelegt nebst Bermerkungen über Atmungsorgane und Körperform der Wirbeltier-Embryonen. Mit 48 Abbildungen. 2. Auflage. Biologischer Verlag, Leipzig 1909 Princeton-USA*
Heinrich Schmidt: Das Biogenetische Grundgesetz Ernst Haeckels und seine Gegner. Mit 18 Abbildungen. 2. umgearbeitete und vermehrte Auflage. Neuer Frankfurter Verlag G. m. b. H., Frankfurt a. M. 1909 California-USA*
Heinrich Schmidt (Hg.): Haeckels Embryonenbilder. Dokumente zum Kampf um die Weltanschauung in der Gegenwart. Mit zahlreichen Abbildungen. Neuer Frankfurter Verlag G. m. b. H., Frankfurt a. M. 1909 Princeton-USA*
Hugo C. Jüngst: Der Sturz Haeckels. Eine Abrechnung. Verlagsbuchhandlung Bruno Volger, Leipzig-Gohlis 1910 Princeton-USA*
M. Reymond: Laienbrevier des Häckelismus. Jubiläumsausgabe 1862–1882–1912. Ernst Reinhardt, München 1912 California-USA*
Werner Schunke: Prüfung des von Ernst Häckel vertretenen Monismus mit einem Anhang: Über Monismus im Allgemeinen. Inauguraldissertation zur Erlangung der Doktorwürde der Philosophischen Fakultät der Königlichen Universität Greifswald. Johann Ambrosius Barth, Leipzig 1913 California-USA*
Ernst Häckel. (Zu seinem 80. Geburtstage.) In: Der Weckruf. Alpenländische volkstümliche Halbmonatsschrift für geistigen und kulturellen Fortschritt, für Politik, Volkswirtschaft, Kunst und Literatur, 4. Jahrgang (1914), 1. Februar 1914, Nr. 2/3, S. 1–3 ÖNB-ANNO
Heinrich Schmidt: Ernst Haeckel. Rede, gehalten am 16. Februar 1914 im großen Volkshaus-Saal zu Jena zur Feier von Haeckels 80. Geburtstag. Alfred Kröner Verlag, Leipzig 1914 Wisconsin-USA*
Heinrich Schmidt (Hg.): Was wir Ernst Haeckel verdanken. Ein Buch der Verehrung und Dankbarkeit. Im Auftrag des deutschen Monistenbundes herausgegeben von Heinrich Schmidt-Jena. Mit 12 Abbildungen, darunter 5 Haeckel-Porträts. Unesma G. m. b. H., Leipzig 1914
2. Auflage. C. Ed. Müller’s Verlagsbuchhandlung, Halle a. S. und Bremen 1901 Internet Archive
6. Tausend. Volksausgabe. Mit einem Anhang: Offener Brief an Professor Dr. Ladenburg in Breslau. C. Ed. Müller’s Verlagsbuchhandlung, Halle a. S. 1904 Internet Archive = Google-USA* = New York-USA*
12. Tausend. Volksausgabe. Mit einem Anhang: Offener Brief an Professor Dr. Ladenburg in Breslau und einem zweiten Anhange: Über Haeckel’s Wahrheitsliebe in Sachen der Entstehung des neutestamentlichen Kanons. C. Ed. Müller’s Verlagsbuchhandlung, Halle a. S. 1908 Internet Archive = Google-USA* = Michigan-USA*
Eberhard Dennert: Die Religion der Naturforscher. Auch eine Antwort auf Haeckels „Welträtsel“. 7. vermehrte und verbesserte Auflage. Verlag der Vaterländischen Verlags- und Kunstanstalt, Berlin 1908 Google-USA* = Michigan-USA*
Wilhelm Teudt: „Im Interesse der Wissenschaft!“ Haeckels „Fälschungen“ und die 46 Zoologen etc. Die wichtigsten Dokumente zum Fall Brass-Haeckel nebst Erläuterungen und Ergebnis. [6.–10.] Tausend. Naturwissenschaftlicher Verlag des Keplerbundes, Godesberg 1909 (= Schriften des Keplerbundes 3) Deutsche Zentralbibliothek für Medizin, California-USA*
Carl W. Neumann: Ernst Haeckel. (Der Mann und sein Werk.) 1. und 2. Tausend. Verlag Gose & Tetzlaff, Berlin [1905?] Google-USA* = Princeton-USA*
Dem Andenken an Ernst Haeckel. In: Arnold Berliner (Hg.) und August Pütter (Hg.): Die Naturwissenschaften. Wochenschrift für die Fortschritte der Naturwissenschaft, der Medizin und der Technik. 7. Jg. Heft 50 (1919). S. 943–971 DigiZeitschriften
Friedrich Ueberweg: Grundriss der Geschichte der Philosophie. 4. Teil. 12. Auflage. Mittler, Berlin 1923, S. 321–325, 706 f. Internet Archive
